蛋白质是由氨基酸组成的生物大分子，氨基酸残基之间通过________键连接起来，蛋白质分子中氨基酸的________构成了

本题考查蛋白质的基本组成和结构相关知识。解题思路如下：

1. 对于第一个空，我们需要了解氨基酸之间是如何连接形成蛋白质的。在生物化学中，一个氨基酸的羧基（$-COOH$）和另一个氨基酸的氨基（$-NH_2$）发生脱水缩合反应，形成一个特殊的化学键。
   • 具体反应式为：$R_1 - CH(NH_2) - COOH + R_2 - CH(NH_2) - COOH \longrightarrow R_1 - CH(NH_2) - CO - NH - CH(R_2) - COOH + H_2O$ ，这里形成的$-CO - NH -$键就是肽键，多个氨基酸通过肽键依次连接就形成了多肽链，进而构成蛋白质，所以第一个空应填“肽”。
2. 对于第二个空，蛋白质具有多种多样的结构和功能，而决定蛋白质结构和功能多样性的关键因素之一就是组成蛋白质的氨基酸的排列顺序。不同的氨基酸排列顺序会导致蛋白质形成不同的空间结构，从而具有不同的功能，所以第二个空应填“排列顺序”。